home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00070 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.0 KB  |  45 lines
  1. **************************************
  2. * Acyl-CoA dehydrogenases signatures *
  3. **************************************
  4.  
  5. Acyl-CoA  dehydrogenases [1,2] are  enzymes  that  catalyze  the   alpha,beta-
  6. dehydrogenation of acyl-CoA esters and transfer electrons to ETF, the electron
  7. transfer protein. There are five known acyl-CoA dehydrogenases:
  8.  
  9.  - Three  of  them  catalyze  the  first step of the beta-oxidation cycles for
  10.    fatty acids with various chain lengths. These are  short (SCAD) (EC 1.3.99.
  11.    2), medium  (MCAD) (EC 1.3.99.3) and long (LCAD) (EC 1.3.99.13) chain acyl-
  12.    CoA dehydrogenases.
  13.  - Isovaleryl-CoA   dehydrogenase   (EC  1.3.99.10)  (IVD),  involved  in  the
  14.    catabolism of leucine.
  15.  - 2-methyl-branched  chain acyl-CoA  dehydrogenase (EC 1.3.99.12) involved in
  16.    isoleucine and valine catabolism.
  17.  
  18. All the above enzymes are homotetrameric FAD  flavoproteins of about 400 amino
  19. acid residues, located in the mitochondrial matrix and structurally related.
  20.  
  21. Escherichia coli hypothetical protein yaaO is  highly similar to the mammalian
  22. enzymes [3].
  23.  
  24. We have  selected  two  conserved  regions as signature patterns. The first is
  25. located in the center of these enzymes, the second in the C-terminal section.
  26.  
  27. -Consensus pattern: [LIVMFYW](3)-N-G-x-K-x-[FYW]-I-[ST]-[NS]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Consensus pattern: Q-x(2)-G-G-x-G-[LIVMFY]-x(2)-[DEN]-x(4)-[KR]-x(3)-D
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  34.  
  35. -Last update: June 1994 / Text revised.
  36.  
  37. [ 1] Tanaka K., Ikeda, Matsubara Y., Hyman D.B.
  38.      Enzyme 38:91-107(1987).
  39. [ 2] Matsubara Y., Indo Y., Naito E., Ozasa H., Glassberg R., Vockley J.,
  40.      Ikeda Y., Kraus J., Tanaka K.
  41.      J. Biol. Chem. 264:16321-16331(1989).
  42. [ 3] Yura T., Mori H., Nagai H., Nagata T., Ishihama A., Fujita N.,
  43.      Isono K., Mizobuchi K., Nakata A.
  44.      Nucleic Acids Res. 20:3305-3308(1992).
  45.